我国生物质发电行业虽然有了较大发展，但还存在着制约行业发展的许多问题：主要有成本问题、技术问题、国家政策支持问题等。成本方面主要是生物质发电厂建设和运营成本相对较高；第一是原料成本高，其次是由于生物质发电相对于常规燃煤火力发电规模较小，在并网以及设备维护方面费用较大。技术方面主要为技术开发能力和产业体系薄弱；生物质能发电产业与上下游配套产业发展不协调，支撑生物质能发电产业发展的技术服务体系较为薄弱。国家政策支持方面主要是与生物质发电相关的政策和措施尚待加强；财税和补贴政策与实际发展不相适应，生物质发电税收优惠政策尚待明确，标准、规范规程体系尚未建立。
针对上述问题，我国应通过技术创新和政策支持来降低生物质发电的成本；加大力度支持技术研究开发和创新，整合现有技术资源，全面提高生物质发电技术创新能力和服务水平；鼓励发电企业进入生物质发电领域，通过上网电价政策、绿色电力配额等政策措施，积极引导现有大型发电企业发展生物质能，提高绿色电力的比例。同时，还应通过电价补贴、生物质原料补贴以及税收优惠等措施，鼓励和支持多种资本进入生物质能发电行业，以促进产业的快速发展。
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