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　　我国生物燃料乙醇产业来取得显著成果，但作为一个新兴产业，生物燃料乙醇产业的发展尚处于起步阶段，产业发展面临着许多问题。为保障国家粮食安全，以粮食为原料的燃料乙醇产业发展受到一定影响；国家虽然鼓励非粮原料燃料乙醇和纤维乙醇（第二代生物燃料）产业的发展，但是受制于非粮原料的供应和纤维乙醇技术成熟度的影响，第二代生物燃料纤维乙醇的技术发展有待进一步突破。我国能源主管部门和若干企业对“非粮”纤维素乙醇寄与厚望，近年来投入大量人力、物力进行开发，取得了重大进展，但总体上距经济效益真正“过关”的大规模产业化尚有较大距离。
　　目前我国燃料乙醇产业化应用主要存在问题包括：（1）乙醇汽油生产的经济问题。生产成本过高是制约我国生物燃料乙醇产业发展的主要因素，因此，要加快燃料乙醇产业的发展，必须研发低成本生产工艺。（2）政府扶持力度减小。我国燃料乙醇产业发展的初期，国家通过财政补贴等优惠政策促进其发展，随后的补贴力度逐渐减小。自2015年1月1日起国家将取消变性燃料乙醇定点生产企业的增值税先征后退政策，同时以粮食为原料生产用于调配车用乙醇汽油的变性燃料乙醇也将恢复征收5%的消费税。财政补贴的缩水，粮价上涨，加之原油价格断崖式下跌，三项叠加使得燃料乙醇行业环境急剧恶化，行业利润被不断侵蚀。
　　针对上述存在的问题，我国应参照美国、巴西等国家发展生物燃料乙醇的经验制定强制性可再生燃料标准，规定运输燃料中必须掺入一定比例的可再生燃料，以此推动生物燃料乙醇和乙醇汽油的推广。另外，在可再生能源发展基金中明确对生物燃料乙醇、尤其是纤维素燃料乙醇项目建设和产品推广的常态化支持，建议综合利用财政政策、金融政策、税收政策、价格政策等手段，大力扶持非粮燃料乙醇尤其是纤维素质原料生产燃料乙醇。